Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOMER3Q9NSC5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOMER3Q9NSC5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms