Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT84Q9NSB2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT84Q9NSB2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT84Q9NSB2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms