Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HINT3Q9NQE9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HINT3Q9NQE9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HINT3Q9NQE9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms