Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK9Q9NPC2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNK9Q9NPC2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNK9Q9NPC2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms