Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRM3Q9NNZ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRM3Q9NNZ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PRM3Q9NNZ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRM3Q9NNZ6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRM3Q9NNZ6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRM3Q9NNZ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRM3Q9NNZ6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRM3Q9NNZ6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRM3Q9NNZ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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