Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF556Q9HAH1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF556Q9HAH1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF556Q9HAH1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms