Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA4Q9BXL8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDCA4Q9BXL8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms