Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC1Q9BTT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC1Q9BTT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC1Q9BTT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms