Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP2Q9BSJ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP2Q9BSJ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms