Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIKE1Q9BRV8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIKE1Q9BRV8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms