Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOXF2Q9BQY4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOXF2Q9BQY4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms