Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOL4Q9BPW4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL4Q9BPW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL4Q9BPW4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms