Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGREF1Q99674 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGREF1Q99674 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms