Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDRT15Q96T59 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDRT15Q96T59 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDRT15Q96T59 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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