Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZIM3Q96PE6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZIM3Q96PE6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms