Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RDH12Q96NR8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDH12Q96NR8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms