Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC3BQ96NL0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNDC3BQ96NL0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms