Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGED4Q96JG8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGED4Q96JG8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGED4Q96JG8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAGED4Q96JG8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms