Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP4Q96DX8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP4Q96DX8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms