Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVL7

ANKRD49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49Q8WVL7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD49Q8WVL7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD49Q8WVL7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD49Q8WVL7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms