Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNIP2Q8NFZ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP2Q8NFZ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP2Q8NFZ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP2Q8NFZ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms