Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIPK4Q8NE63 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK4Q8NE63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK4Q8NE63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms