Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF148Q8N7C7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF148Q8N7C7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF148Q8N7C7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF148Q8N7C7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF148Q8N7C7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF148Q8N7C7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF148Q8N7C7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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