Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO5AQ8N6Q1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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