Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M8

IQCF1, IQ domain-containing protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCF1Q8N6M8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IQCF1Q8N6M8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IQCF1Q8N6M8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IQCF1Q8N6M8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.8 ms