Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT20Q8IY31 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT20Q8IY31 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT20Q8IY31 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms