Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7D3

VTCN1, V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTCN1Q7Z7D3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTCN1Q7Z7D3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTCN1Q7Z7D3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTCN1Q7Z7D3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms