Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5S9

TMEM144, Transmembrane protein 144, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM144Q7Z5S9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM144Q7Z5S9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM144Q7Z5S9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM144Q7Z5S9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM144Q7Z5S9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM144Q7Z5S9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM144Q7Z5S9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM144Q7Z5S9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms