Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSX6Q7RTT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX6Q7RTT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms