Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGM2L1Q6PCE3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGM2L1Q6PCE3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PGM2L1Q6PCE3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGM2L1Q6PCE3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGM2L1Q6PCE3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM2L1Q6PCE3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM2L1Q6PCE3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM2L1Q6PCE3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms