Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM68Q6AZZ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM68Q6AZZ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms