Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ECM29Q5VYK3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ECM29Q5VYK3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ECM29Q5VYK3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms