Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF3Q5VWG9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TAF3Q5VWG9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms