Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACHD1Q5VU97 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACHD1Q5VU97 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACHD1Q5VU97 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACHD1Q5VU97 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACHD1Q5VU97 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACHD1Q5VU97 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACHD1Q5VU97 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACHD1Q5VU97 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACHD1Q5VU97 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACHD1Q5VU97 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms