Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX1Q5SQQ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX1Q5SQQ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms