Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms