Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD39Q53RE8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD39Q53RE8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms