Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP221Q4G0U5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFAP221Q4G0U5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP221Q4G0U5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms