Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP21-3Q3LHN1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP21-3Q3LHN1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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