Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX1Q16384 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX1Q16384 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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