Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A5Q15758 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A5Q15758 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A5Q15758 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC1A5Q15758 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A5Q15758 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms