Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA9Q13797 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA9Q13797 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms