Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPBGQ13641 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPBGQ13641 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPBGQ13641 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms