Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 40
TARDBPQ13148 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 214.6□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 40
TARDBPQ13148 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 40
TARDBPQ13148 ZNF251-202ENST00000524394 315 ntTSL 515.85■□□□□ 0.139e-11■■■■■ 40
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TARDBPQ13148 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 40
TARDBPQ13148 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 40
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TARDBPQ13148 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.735e-12■■■■■ 40
TARDBPQ13148 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.145e-12■■■■■ 40
TARDBPQ13148 EED-211ENST00000534595 713 ntTSL 312.48□□□□□ -0.415e-12■■■■■ 40
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TARDBPQ13148 EED-205ENST00000525244 1484 ntTSL 24.48□□□□□ -1.695e-12■■■■■ 40
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TARDBPQ13148 SRSF10-202ENST00000341154 2839 ntTSL 211.56□□□□□ -0.565e-10■■■■■ 39.9
TARDBPQ13148 SRSF10-203ENST00000343255 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.765e-10■■■■■ 39.9
TARDBPQ13148 SRSF10-214ENST00000492112 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.85e-10■■■■■ 39.9
TARDBPQ13148 SRSF10-206ENST00000374453 866 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.815e-10■■■■■ 39.9
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TARDBPQ13148 SRSF10-201ENST00000338597 813 ntTSL 24.29□□□□□ -1.725e-10■■■■■ 39.9
TARDBPQ13148 SYMPK-212ENST00000598896 1899 ntTSL 1 (best)21.63■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 39.9
TARDBPQ13148 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 39.9
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TARDBPQ13148 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 39.9
TARDBPQ13148 BLVRB-203ENST00000597870 1392 ntTSL 518.22■□□□□ 0.515e-21■■■■■ 39.8
TARDBPQ13148 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.095e-21■■■■■ 39.8
TARDBPQ13148 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.375e-21■■■■■ 39.8
TARDBPQ13148 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 39.8
TARDBPQ13148 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 39.8
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TARDBPQ13148 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.521e-7■■■■■ 39.8
TARDBPQ13148 IMMP2L-208ENST00000487733 580 ntTSL 27.58□□□□□ -1.25e-7■■■■■ 39.8
TARDBPQ13148 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.089e-8■■■■■ 39.7
TARDBPQ13148 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-27■■■■■ 39.7
TARDBPQ13148 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-27■■■■■ 39.7
TARDBPQ13148 AC120114.5-201ENST00000562285 556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.592e-27■■■■■ 39.7
TARDBPQ13148 STEAP1B-204ENST00000439708 797 ntTSL 36.67□□□□□ -1.347e-7■■■■■ 39.6
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TARDBPQ13148 ANK1-209ENST00000520299 3587 ntTSL 29.51□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 39.6
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TARDBPQ13148 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 215.13■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 39.6
TARDBPQ13148 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 39.6
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TARDBPQ13148 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 39.6
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TARDBPQ13148 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 39.5
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TARDBPQ13148 TTC3-224ENST00000494243 861 ntTSL 524.4■■□□□ 1.52e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 TTC3-217ENST00000481605 1540 ntTSL 523.78■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 39.4
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TARDBPQ13148 TTC3-209ENST00000438055 3606 ntTSL 515.97■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 TTC3-207ENST00000418766 3771 ntTSL 515.63■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 TTC3-219ENST00000485402 3626 ntTSL 514.08□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.121e-11■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-210ENST00000494354 925 ntTSL 417.82■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-207ENST00000472909 587 ntTSL 417.82■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-209ENST00000493391 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-204ENST00000434377 5197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-203ENST00000427002 584 ntTSL 28.84□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-208ENST00000480361 474 ntTSL 48.37□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-205ENST00000452939 793 ntTSL 26.56□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ZNF566-206ENST00000460937 570 ntTSL 44.75□□□□□ -1.655e-7■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -09e-11■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 NPHP4-207ENST00000470763 3156 ntTSL 213.3□□□□□ -0.289e-11■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.317e-11■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.165e-30■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.47e-11■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.447e-11■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.475e-30■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.527e-11■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.577e-11■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-217ENST00000604981 759 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.995e-30■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-210ENST00000442293 546 ntTSL 58.78□□□□□ -15e-30■■■■■ 39.4
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