Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 SPS1YDR523C 1473 nt6.12□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 KEL1YHR158C 3495 nt6.12□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 YIL077CYIL077C 963 nt6.12□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 DUS4YLR405W 1104 nt6.12□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 RMD9YGL107C 1941 nt6.11□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 PIL1YGR086C 1020 nt6.11□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 DSC3YOR223W 879 nt6.11□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 CST26YBR042C 1194 nt6.11□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 OAC1YKL120W 975 nt6.1□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 TOS6YNL300W 309 nt6.1□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 MCP1YOR228C 909 nt6.1□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 MBF1YOR298C-A 456 nt6.1□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 YEL020CYEL020C 1683 nt6.1□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 CYS3YAL012W 1185 nt6.09□□□□□ -1.43
RTR2Q12378 COX9YDL067C 180 nt6.08□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 YDR415CYDR415C 1125 nt6.08□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 PRS4YBL068W 981 nt6.08□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 ESC8YOL017W 2145 nt6.08□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 HIS7YBR248C 1659 nt6.07□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 HAL5YJL165C 2568 nt6.07□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 TRS31YDR472W 852 nt6.07□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 PET117YER058W 324 nt6.07□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 TRR2YHR106W 1029 nt6.07□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 AAD14YNL331C 1131 nt6.07□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 MIP1YOR330C 3765 nt6.07□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 PMT3YOR321W 2262 nt6.06□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 GPI11YDR302W 660 nt6.06□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 AIM46YHR199C 933 nt6.06□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 YML122CYML122C 381 nt6.06□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 YBL070CYBL070C 321 nt6.06□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 YDR514CYDR514C 1452 nt6.06□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 YDR387CYDR387C 1668 nt6.06□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 SKP1YDR328C 585 nt6.05□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 PUS4YNL292W 1212 nt6.05□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 ZIM17YNL310C 525 nt6.05□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 YOR111WYOR111W 699 nt6.05□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 AFG1YEL052W 1530 nt6.04□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 HAS1YMR290C 1518 nt6.04□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 SAC6YDR129C 1929 nt6.04□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 CCW12YLR110C 402 nt6.04□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 LDB19YOR322C 2457 nt6.03□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 SKN1YGR143W 2316 nt6.03□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 QNS1YHR074W 2145 nt6.03□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 LGE1YPL055C 999 nt6.03□□□□□ -1.44
RTR2Q12378 YCR049CYCR049C 447 nt6.02□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 YPT1YFL038C 621 nt6.02□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 PAM17YKR065C 594 nt6.02□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 MOD5YOR274W 1287 nt6.02□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 HEM1YDR232W 1647 nt6.02□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 CRP1YHR146W 1398 nt6.02□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 YML133CYML133C 4125 nt6.02□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 YPQ2YDR352W 954 nt6.01□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 URH1YDR400W 1023 nt6.01□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 DMC1YER179W 1005 nt6.01□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 YJL213WYJL213W 996 nt6.01□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 SPE3YPR069C 882 nt6.01□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 UTR2YEL040W 1404 nt6□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 DML1YMR211W 1428 nt6□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 PAT1YCR077C 2391 nt6□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 IRC11YOR013W 471 nt6□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 RPS28AYOR167C 204 nt6□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 LSG1YGL099W 1923 nt5.99□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 STB5YHR178W 2232 nt5.99□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 YDL177CYDL177C 513 nt5.99□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 YNL092WYNL092W 1203 nt5.99□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 PLB3YOL011W 2061 nt5.98□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 MTC5YDR128W 3447 nt5.98□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 SML1YML058W 315 nt5.98□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 snR30snR30 606 nt5.98□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 NFS1YCL017C 1494 nt5.97□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 DPM1YPR183W 804 nt5.97□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 PYK2YOR347C 1521 nt5.97□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 BZZ1YHR114W 1902 nt5.97□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 YHR131CYHR131C 2553 nt5.97□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 UBP13YBL067C 2244 nt5.97□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 PFK2YMR205C 2880 nt5.96□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 CIT2YCR005C 1383 nt5.96□□□□□ -1.45
RTR2Q12378 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 FBA1YKL060C 1080 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 ICT1YLR099C 1185 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 MPH3YJR160C 1809 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 MRC1YCL061C 3291 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 TUB1YML085C 1344 nt5.96□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 HXT17YNR072W 1695 nt5.95□□□□□ -1.46
RTR2Q12378 PDA1YER178W 1263 nt5.95□□□□□ -1.46
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