Protein–RNA interactions for Protein: Q12365

BBP1, Spindle pole component BBP1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BBP1Q12365 PMT3YOR321W 2262 nt6.15□□□□□ -1.42
BBP1Q12365 HPT1YDR399W 666 nt6.15□□□□□ -1.42
BBP1Q12365 TRS31YDR472W 852 nt6.15□□□□□ -1.42
BBP1Q12365 CRP1YHR146W 1398 nt6.15□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 MRPS12YNR036C 462 nt6.14□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 RPS28AYOR167C 204 nt6.13□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 MOD5YOR274W 1287 nt6.13□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 RPL43AYPR043W 279 nt6.13□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 IVY1YDR229W 1362 nt6.12□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 YJL213WYJL213W 996 nt6.12□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 HRB1YNL004W 1365 nt6.12□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 LDB19YOR322C 2457 nt6.12□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 YDR415CYDR415C 1125 nt6.11□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 ICT1YLR099C 1185 nt6.11□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 ATP23YNR020C 813 nt6.11□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 FET4YMR319C 1659 nt6.1□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 OSM1YJR051W 1506 nt6.1□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 EDC2YER035W 438 nt6.1□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 YJR142WYJR142W 1029 nt6.1□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 PSR2YLR019W 1194 nt6.1□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 YLR358CYLR358C 564 nt6.1□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 HEM1YDR232W 1647 nt6.1□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 YMR279CYMR279C 1623 nt6.1□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 UTR2YEL040W 1404 nt6.09□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 PIL1YGR086C 1020 nt6.09□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 YNL092WYNL092W 1203 nt6.09□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 MSI1YBR195C 1269 nt6.09□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 PTK2YJR059W 2457 nt6.09□□□□□ -1.43
BBP1Q12365 GYP8YFL027C 1494 nt6.09□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 AMA1YGR225W 1782 nt6.08□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 YFL042CYFL042C 2025 nt6.08□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 VPS5YOR069W 2028 nt6.08□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 YGL081WYGL081W 963 nt6.08□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 KAE1YKR038C 1161 nt6.08□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 CLB2YPR119W 1476 nt6.08□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 YML133CYML133C 4125 nt6.08□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 STE13YOR219C 2796 nt6.07□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 SKP1YDR328C 585 nt6.07□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 CCW12YLR110C 402 nt6.07□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 CBK1YNL161W 2271 nt6.07□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 YPT1YFL038C 621 nt6.05□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 XBP1YIL101C 1944 nt6.05□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 HSP104YLL026W 2727 nt6.04□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 URH1YDR400W 1023 nt6.04□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 PET117YER058W 324 nt6.04□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 DMC1YER179W 1005 nt6.04□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 NMA2YGR010W 1188 nt6.04□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 IRC11YOR013W 471 nt6.04□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 SDH8YBR269C 417 nt6.04□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 NTE1YML059C 5040 nt6.04□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 CIT2YCR005C 1383 nt6.04□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 MCM6YGL201C 3054 nt6.03□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 YCR049CYCR049C 447 nt6.03□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 PAM17YKR065C 594 nt6.03□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 PPM2YOL141W 2088 nt6.03□□□□□ -1.44
BBP1Q12365 HXT15YDL245C 1704 nt6.02□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 HXT16YJR158W 1704 nt6.02□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 FMP40YPL222W 2067 nt6.02□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 VPS70YJR126C 2436 nt6.02□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 YJR154WYJR154W 1041 nt6.02□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 YOR268CYOR268C 399 nt6.02□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 ALD6YPL061W 1503 nt6.02□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 PRP24YMR268C 1335 nt6.01□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 SCT1YBL011W 2280 nt6.01□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 VPS61YDR136C 573 nt6.01□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 FBA1YKL060C 1080 nt6.01□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 ARA2YMR041C 1008 nt6.01□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 YBR124WYBR124W 360 nt6.01□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 MKK1YOR231W 1527 nt6□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 YPQ2YDR352W 954 nt6□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 DOC1YGL240W 753 nt6□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 RHO4YKR055W 876 nt6□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 RBS1YDL189W 1374 nt6□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 GPA2YER020W 1350 nt6□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 YBR113WYBR113W 483 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 MKK2YPL140C 1521 nt5.99□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 MRPL1YDR116C 858 nt5.98□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 DPM1YPR183W 804 nt5.98□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 PRY3YJL078C 2646 nt5.97□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 MPA43YNL249C 1629 nt5.97□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 YDL177CYDL177C 513 nt5.97□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 NAS6YGR232W 687 nt5.97□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 PIH1YHR034C 1035 nt5.97□□□□□ -1.45
BBP1Q12365 CBR1YIL043C 855 nt5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.9 ms