Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YDR467CYDR467C 327 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 RAD51YER095W 1203 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YGL235WYGL235W 537 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YHR112CYHR112C 1137 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 IST3YIR005W 447 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 PEX13YLR191W 1161 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 HAP5YOR358W 729 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 CUP9YPL177C 921 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 RSA1YPL193W 1146 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 PUS7YOR243C 2031 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 KEL3YPL263C 1956 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YCR100CYCR100C 951 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YDL027CYDL027C 1263 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YGL185CYGL185C 1140 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 ERP5YHR110W 639 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 URA4YLR420W 1095 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 HFI1YPL254W 1467 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 OCH1YGL038C 1443 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 MAK32YCR019W 1092 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 HEM3YDL205C 984 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YGR026WYGR026W 837 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 OPI1YHL020C 1215 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 SDS3YIL084C 984 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 AIM22YJL046W 1230 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 BLS1YLR408C 369 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 SWT21YNL187W 1074 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 RCL1YOL010W 1104 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 MIM1YOL026C 342 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 FSF1YOR271C 984 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 NHP10YDL002C 612 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 STE2YFL026W 1296 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 DUO1YGL061C 744 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 DRE2YKR071C 1047 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 ROT1YMR200W 771 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 CLD1YGR110W 1338 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 RPN14YGL004C 1254 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 POT1YIL160C 1254 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YLR194CYLR194C 765 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 TAF13YML098W 504 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YPR147CYPR147C 915 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 MET1YKR069W 1782 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 BUD26YDR241W 288 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YGL101WYGL101W 648 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 PSY3YLR376C 729 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 MRPS17YMR188C 714 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 RUF22RUF22 515 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YGP1YNL160W 1065 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 CRC1YOR100C 984 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YPL136WYPL136W 369 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YPL245WYPL245W 1365 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 LDB17YDL146W 1476 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YDR401WYDR401W 564 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 CAB1YDR531W 1104 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 GIM4YEL003W 336 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 GTO1YGR154C 1071 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YHB1YGR234W 1200 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 CPD1YGR247W 720 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YLR456WYLR456W 615 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 HAL1YPR005C 885 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 HBS1YKR084C 1836 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 FRA1YLL029W 2250 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 PTM1YKL039W 1572 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YDR306CYDR306C 1437 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 ATC1YDR184C 885 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 NIF3YGL221C 867 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 UPF3YGR072W 1164 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 PCT1YGR202C 1275 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 MRPL6YHR147C 645 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 INP1YMR204C 1263 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 MST1YKL194C 1389 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 APM4YOL062C 1476 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 SPO77YLR341W 1434 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 PHM8YER037W 966 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 ORM1YGR038W 669 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 DAM1YGR113W 1032 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 APS2YJR058C 444 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 PSR2YLR019W 1194 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YML099W-AYML099W-A 330 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 DLT1YMR126C 1029 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 AMF1YOR378W 1548 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YGR291CYGR291C 222 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 PPE1YHR075C 1203 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YKL053WYKL053W 375 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 SEC65YML105C 822 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YNL134CYNL134C 1131 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-BLQ12266 YOL166CYOL166C 339 nt7.53□□□□□ -1.2
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