Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 ERG8YMR220W 1356 nt6.79□□□□□ -1.32
LCB4Q12246 YDR187CYDR187C 519 nt6.78□□□□□ -1.32
LCB4Q12246 MRPL28YDR462W 444 nt6.78□□□□□ -1.32
LCB4Q12246 SNT309YPR101W 528 nt6.78□□□□□ -1.32
LCB4Q12246 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.77□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YJL211CYJL211C 444 nt6.77□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 MHT1YLL062C 975 nt6.77□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YLR463CYLR463C 552 nt6.77□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 CDC1YDR182W 1476 nt6.77□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YPL277CYPL277C 1464 nt6.77□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YMR034CYMR034C 1305 nt6.76□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YCR041WYCR041W 333 nt6.76□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.76□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 TMA46YOR091W 1038 nt6.76□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 EEB1YPL095C 1371 nt6.76□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YEL023CYEL023C 2049 nt6.76□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 TRS31YDR472W 852 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YRB2YIL063C 984 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YAR064WYAR064W 300 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 AVO2YMR068W 1281 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YBR027CYBR027C 333 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 TAE1YBR261C 699 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 RRP9YPR137W 1722 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 PPM2YOL141W 2088 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 COQ1YBR003W 1422 nt6.75□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YHR020WYHR020W 2067 nt6.74□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YDL177CYDL177C 513 nt6.74□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 HIS1YER055C 894 nt6.74□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 AMN1YBR158W 1650 nt6.74□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YJL045WYJL045W 1905 nt6.74□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 PAC2YER007W 1557 nt6.74□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YOR389WYOR389W 1875 nt6.73□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 FYV1YDR024W 486 nt6.73□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YSC83YHR017W 1158 nt6.73□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YLR112WYLR112W 420 nt6.73□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 TDH2YJR009C 999 nt6.72□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YML018CYML018C 1182 nt6.72□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 NUP84YDL116W 2181 nt6.72□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 SRF1YDL133W 1314 nt6.72□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YHK8YHR048W 1545 nt6.71□□□□□ -1.33
LCB4Q12246 YKR023WYKR023W 1593 nt6.71□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 MAK32YCR019W 1092 nt6.71□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 AIM2YAL049C 741 nt6.71□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 YOR012WYOR012W 414 nt6.71□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 ERS1YCR075C 783 nt6.7□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 TRR1YDR353W 960 nt6.7□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 TFG2YGR005C 1203 nt6.7□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 MTR3YGR158C 753 nt6.7□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 YMR122CYMR122C 375 nt6.7□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 FSF1YOR271C 984 nt6.7□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 UIP5YKR044W 1332 nt6.7□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 CCT8YJL008C 1707 nt6.7□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 STF1YDL130W-A 261 nt6.69□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 CUP2YGL166W 678 nt6.69□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 MPC2YHR162W 390 nt6.69□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 ATG36YJL185C 882 nt6.69□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 IRC11YOR013W 471 nt6.69□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 RGD2YFL047W 2145 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 STT3YGL022W 2157 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 VMA3YEL027W 483 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 DID2YKR035W-A 615 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 YMR295CYMR295C 594 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 YDR387CYDR387C 1668 nt6.68□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.67□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 SEC23YPR181C 2307 nt6.67□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 COX10YPL172C 1389 nt6.67□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 ZWF1YNL241C 1518 nt6.66□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 HHY1YEL059W 309 nt6.66□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 MSP1YGR028W 1089 nt6.66□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 EFM1YHL039W 1758 nt6.66□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 YMR279CYMR279C 1623 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 RNH201YNL072W 924 nt6.65□□□□□ -1.34
LCB4Q12246 YBR241CYBR241C 1467 nt6.65□□□□□ -1.35
LCB4Q12246 RFC4YOL094C 972 nt6.64□□□□□ -1.35
LCB4Q12246 CTF19YPL018W 1110 nt6.64□□□□□ -1.35
LCB4Q12246 PZF1YPR186C 1290 nt6.64□□□□□ -1.35
LCB4Q12246 EDC3YEL015W 1656 nt6.64□□□□□ -1.35
LCB4Q12246 PPH22YDL188C 1134 nt6.63□□□□□ -1.35
LCB4Q12246 KIN1YDR122W 3195 nt6.63□□□□□ -1.35
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