Protein–RNA interactions for Protein: Q12235

YCT1, High affinity cysteine transporter, yeastyeast

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YCT1Q12235 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 YLR358CYLR358C 564 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 YPR130CYPR130C 408 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 MIP1YOR330C 3765 nt5.73□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 KNS1YLL019C 2214 nt5.72□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 PET494YNR045W 1470 nt5.72□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 YPT1YFL038C 621 nt5.72□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 YNR005CYNR005C 405 nt5.72□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 POX1YGL205W 2247 nt5.72□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 MKK1YOR231W 1527 nt5.72□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 FRE5YOR384W 2085 nt5.71□□□□□ -1.49
YCT1Q12235 HEM1YDR232W 1647 nt5.71□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 RRP46YGR095C 672 nt5.71□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YNL017CYNL017C 339 nt5.71□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 COX5AYNL052W 462 nt5.71□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 HTZ1YOL012C 405 nt5.71□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YPR204WYPR204W 3099 nt5.71□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 ISC1YER019W 1434 nt5.71□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YHR020WYHR020W 2067 nt5.7□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 NSE5YML023C 1671 nt5.7□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 CDC16YKL022C 2523 nt5.7□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 PMT3YOR321W 2262 nt5.69□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 CIA1YDR267C 993 nt5.69□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 MRPS28YDR337W 861 nt5.69□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 ATG36YJL185C 882 nt5.69□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 ERG10YPL028W 1197 nt5.69□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 PPM2YOL141W 2088 nt5.69□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 CYC8YBR112C 2901 nt5.69□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YIL055CYIL055C 1884 nt5.68□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YUR1YJL139C 1287 nt5.68□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 IDP3YNL009W 1263 nt5.68□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YBR113WYBR113W 483 nt5.68□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 RIO1YOR119C 1455 nt5.68□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 ARG81YML099C 2643 nt5.68□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 NMT1YLR195C 1368 nt5.67□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 EDE1YBL047C 4146 nt5.67□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 SOD2YHR008C 702 nt5.67□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 PAU21YOR394W 495 nt5.67□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 PAU22YPL282C 495 nt5.67□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 SMX3YPR182W 261 nt5.67□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YBR284WYBR284W 2394 nt5.67□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 ATF1YOR377W 1578 nt5.67□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 SLX5YDL013W 1860 nt5.66□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 APE4YHR113W 1473 nt5.66□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YGL102CYGL102C 429 nt5.66□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 FBA1YKL060C 1080 nt5.66□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 TMA46YOR091W 1038 nt5.66□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YPL067CYPL067C 597 nt5.66□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 STT3YGL022W 2157 nt5.66□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 GDA1YEL042W 1557 nt5.65□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 TRR2YHR106W 1029 nt5.65□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 MIA40YKL195W 1212 nt5.65□□□□□ -1.5
YCT1Q12235 YFR006WYFR006W 1608 nt5.65□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 RAP1YNL216W 2484 nt5.65□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 UTR2YEL040W 1404 nt5.65□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 PRI1YIR008C 1230 nt5.64□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 HED1YDR014W-A 489 nt5.63□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 PIH1YHR034C 1035 nt5.63□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 RPP1YHR062C 882 nt5.63□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 PRS4YBL068W 981 nt5.63□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 YPQ1YOL092W 927 nt5.63□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 DFR1YOR236W 636 nt5.63□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 YCL049CYCL049C 939 nt5.63□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 THI2YBR240C 1353 nt5.63□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 MAK32YCR019W 1092 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 PDA1YER178W 1263 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 SQT1YIR012W 1296 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 RIB1YBL033C 1038 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 PTH2YBL057C 627 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 MRPL19YNL185C 477 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 snR30snR30 606 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 HXT15YDL245C 1704 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 HXT16YJR158W 1704 nt5.62□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 POP1YNL221C 2628 nt5.61□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 YLL056CYLL056C 897 nt5.61□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 KSH1YNL024C-A 219 nt5.61□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 COQ1YBR003W 1422 nt5.61□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 ICP55YER078C 1536 nt5.6□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 CCC2YDR270W 3015 nt5.6□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 UME1YPL139C 1383 nt5.6□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 SWD1YAR003W 1281 nt5.6□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 YBL070CYBL070C 321 nt5.6□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 SEC62YPL094C 825 nt5.6□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 SNU71YGR013W 1863 nt5.6□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 HXK2YGL253W 1461 nt5.59□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 MSY1YPL097W 1479 nt5.59□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 CRP1YHR146W 1398 nt5.59□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 SPS22YCL048W 1392 nt5.59□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 ICS3YJL077C 396 nt5.59□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 YNL120CYNL120C 486 nt5.59□□□□□ -1.51
YCT1Q12235 YFL052WYFL052W 1398 nt5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8967.9 ms