Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms